Mikrobiologiczne przemiany kopalnej materii organicznej

Skały osadowe są jednym z największych na Ziemi rezerwuarów kopalnego węgla organicznego. Tylko mikroorganizmy są zdolne do degradacji kopalnej materii organicznej zdeponowanej w skałach osadowych, a mikrobiologiczne procesy wietrzenia skał osadowych mają ogromne znaczenie w obiegu węgla na Ziemi. Bioutlenienie kopalnej materii organicznej przez mikroorganizmy może prowadzić do redystrybucji węgla w litosferze, a także może mieć wpływ na skład chemiczny wód i zawartość gazów w atmosferze.

Przykładem kopalnej skały osadowej jest polimetaliczna skała łupkowa występująca na obszarze monokliny przedsudeckiej. Skała ta powstała ok. 256 mln lat temu i należy do jednych z największych na świecie złóż rudy miedzi. Zawartość węgla organicznego w Kupferschiefer wynosi nawet do 30% wag. Kopalna materia organiczna Kupferschiefer to gazotwórczy i ropotwórczy kerogen II.

Celem naszych badań jest detekcja mikroorganizmów zdolnych do przemian kopalnej materii organicznej oraz opisanie szlaków biochemicznych, takich procesów jak:

utlenienie i odwodornienie kerogenu
utlenienie kopalnych węglowodorów alifatycznych i aromatycznych
utlenienie bituminu i mobilizacja węgla organicznego
bakteryjne przemiany protoporfiryn osadowych
bakteryjne przemiany geoporfiryn niklowych i wanadylowych
halogenacja i dehalogenacja kopalnych związków organicznych
przemiany związków jednowęglowych (metanogeneza, metylotrofia i metanotrofia)